Saaristomeren vedenalaiset meriluontoalueet on selvitetty vuosina 2025–2026 osana vedenalaisen meriluonnon monimuotoisuuden inventointiohjelmaa (Velmu-ohjelma). Suomen ympäristökeskuksen mukaan Saaristomereltä tunnistettiin yhteensä 46 paikallisesti ekologisesti merkittävää vedenalaista meriluontoaluetta.
Vakka-Suomesta listalle pääsivät Muntilanaukko Lokalahdelta, Maikarin laguuni Uudenkaupungin ja Taivassalon rajalta, Kihdin pohjoisosa Kustavista ja Kustavin fladat sekä Taivassalon ja Mynämäen rajalla sijaitseva Mynälahti.